二院99号综合科研楼拟建于北京市海淀区永定路航天部二院东工业区绿化带以东地区，东侧为九街坊，西侧为中心绿化带，南侧为92号机电设备研发楼，北侧为93号弹上设备研发楼。建筑为一类高层综合楼，平面整体呈C型。东西总长179.50m，南北总宽216.20m，建筑面积为273600m²，占地面积为29981.80m²，地上建筑面积为166000m²。建筑物高度40m；地下三层，地上九层，结构类型为框架剪力墙结构及框架结构。地上建筑分为北段--A座（技术基础大楼）、中段--B座（信息展示中心）、南段—C座（计算机大楼）。建筑立面主体采用石材及玻璃幕墙。灰色石材，与整个航天二院东工业区色调协调统一，形成统一的空间序列，主入口及一层采用深灰色花岗岩，既丰富了立面韵律，又突出了入口设计。